ZEN - Module BioMed

ZEN desk Modul 3Dxl Variante zur Verwendung des 3Dxl Moduls in ZEN desk. Modul zur Visualisierung und Analyse von 3D oder 4D Bilddaten. 3Dxl ermöglicht das Rendern von 3D-Daten mit ray-tracing basierten Transparenz-Volumen-Modellen, Maximumintensitäts-Projektion und Oberflächen-Renderings. Zeitreihen (4D)/Movies, das Erzeugen und Exportieren von Movies sowie Werkzeuge zur interaktiven 3D Messung sind ebenfalls Teil von 3Dxl. 3Dxl basiert auf Technologie der arivis AG (www.arivis.com) und ist daher besonders geeignet für das Bearbeiten von Datensätzen die größer sind als der Grafik Speicher des Computers.

ZEN Modul FRAP Efficiency Analysis Auswertung von FRAP/FLIP und ähnlichen Zeitserien mit Bleichevents zur Bestimmung der Halbwertszeit der Wiederherstellung / der Verminderung des Fluoreszenzsignals mit mono oder bi-exponentiellen Fit Algorithmen inklusive Optionen zur Hintergrundkorrektur, Korrektur für Aufnahme bedingtes Photobleichen und der Möglichkeit, ROIs gruppiert auszuwerten.

ZEN Modul FRET Analyse von FRET Daten, die mit der Methode ''Sensitized Emission'' oder ''Acceptor Photobleaching'' erstellt wurden. Das Modul beinhaltet einen speziellen FRET View mit der Berechnung von Kontrollparametern, einer farbcodierten Darstellung des Ergebnisbildes sowie die Intensitätsverläufe ausgewählter Bildregionen. Die drei häufigsten Analysemethoden werden unterstützt: Gordon, Xia, Youvan.

ZEN Modul 3D VisArt Hardware License Key Modul zur Visualisierung von 3D Bildstapeln als Volumen-Modelle, Zeitreihen (4D)/Movies, verschiedene Renderingmethoden, Maximumintensitäts-Projektion. Werkzeuge zur interaktiven 3D-Messung.

ZEN Modul Deconvolution Hardware License Key Modul zur Verbesserung von 3D Bildstapeln durch 3D Dekonvolutions- Algorithmen, Verfahren für theoretische PSF.

Software Modul ZEN 2014 zur Datenverarbeitung Lightsheet Z.1 inklusive der Rekonstruktion und Analyse von 3D-Multiview-Daten (Deconvolution, Registrierung, Fusion), dieses Modul erlaubt von einem Auswerte-PC aus bereits mit dem Prozessieren der Daten zu beginnen bevor das Experiment abgeschlossen ist (Voraussetzung: Die Aufnahme und Datenspeicherung des ersten Zeitpunktes einer Zeitserie muss abgeschlossen sein)

ZEN Feature upgrade für Lightsheet Z.1 Folgende Acquisefunktionen werden mit diesem Modul freigeschalten: - Probenhalter für große Proben konfigurierbar mit Config Tool - Aufnahmegeschwindigkeit bis 200 Mbyte/s - Integrationszeit für pco.edge sCMOS bis minimal 2.5 ms - Einstellbarer Brechungsindex für Medien - Z-offset Kompensation

ZEN Processing Software Package für Lightsheet 7

ZEN Modul Dekonvolution Modul zur Verbesserung von 3D Bildstapeln durch 3D Dekonvolutions-Algorithmen, Verfahren für theoretische PSF. Erheblicher Geschwindigkeitsgewinn bei Verwendung geeigneter Nvidia GPU.